La famille des Rivulidae comporte actuellement 39 genres répartis en trois sous-familles. De plus, les sous-familles sont divisées en différentes tribus.

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Toutefois, l'exactitude de la taxonomie présentée ci-dessous ne peut être garantie au sein de l'«International Rivulid Conservation Program». Enfin, la taxonomie n'est pas la tâche principale de l'IRCP.

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Rivulidae

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​Cynolebiinae

​Cynolebiini

​Austrolebias

Cynolebias

Hypsolebias

Nematolebias

Ophthalmolebias

Simpsonichthys

Spectrolebias

Xenurolebias

​Cynopoecilini

​Campellolebias

Cynopoecilus

Leptolebias

Leptopanchax

Mucurilebias

Notholebias

 

Kryptolebiatinae

​Kryptolebias

Rivulinae

(Les cinq genres supérieurs sont parfois considérés comme des sous-genres de Rivulus. Austrofundulus est considéré comme un synonyme de Rachovia dans quelques cas et Aphyolebias comme un genre distinct. - La relation entre les six genres et les deux tribus n'est pas claire.)

Anablepsoides

Atlantirivulus

Cynodonichthys

​Laimosemion

Melanorivulus

Rivulus

​Neofundulini

​Austrofundulus

Gnatholebias

Llanolebias

Micromoema

Moema (syn.: Aphyolebias)

Neofundulus

Pterolebias

Rachovia

Renova

Terranatos

Trigonectes

​Plesiolebiini

​Maratecoara

Papiliolebias

Pituna

Plesiolebias

Stenolebias

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Relation incertaine

​Millerichthys

Prorivulus

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La dénomination des sous-familles et des tribes ci-dessus correspond à VAN DER LAAN, R. (2019): Case 3793 - Request for a confirmation of the correct stem for family-group names proposed before 2000 and typified by fish genera with names ending in -lebias. Bulletin of Zoological Nomenclature 76. et VAN DER LAAN, R., ESCHMEYER, W. N. & FRICKE, R. (2014): Family-group names of Recent fishes. Zootaxa 3882 (2).

Pour le reste, la taxonomie présentée ci-dessus correspond à LOUREIRO, M. et al. (2018): Review of the family Rivulidae (Cyprinodontiformes, Aplocheiloidei) and a molecular and morphological phylogeny of the annual fish genus Austrolebias Costa 1998. Neotropical Ichthyology, 16 (3): e180007., à l'exception de la synonymie d'Austrofundulus avec Rachovia, car cette approche ne semble pas être généralement acceptée et le fractionnement de Rachovia en deux genres semble plus judicieux pour corriger la paraphylie de Rachovia.

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Par souci d'exhaustivité, une opinion alternative sur la taxonomie de la famille Rivulidae est mentionnée ici: https://www.killi-data.org/list-names-familygroup.php